- Co jsou to karcinogeny, jak je dělíme, uveďte konkrétní příklady, způsoby testování mutagenity
- Definujte pojem karcinogeneze, klonalita, onkogen a nádorový supresor
- Buněčný cyklus a metody jeho studia
- Buněčná smrt, klasifikace a metody detekce
- Hlavní znaky nádorové buňky, klasifikace, příklady molekulárního mechanismu
- PCR, princip a využití metody, PCR v reálném čase, reverzní transkripce
- Fluorescenční sondy pro qPCR, absolutní a relativní kvantifikace
- Hybridizace nukleových kyselin, metody a jejich využití
- Metody detekce mutací DNA – (RFLP, ASO, OLA, DHPLC, PPT, MLPA, HRM)
- Metody detekce mutací DNA – sekvenační metody
- Elektroforetická separace nukleových kyselin, klasifikace, detekce, využití
- Metody izolace nukleových kyselin (DNA, RNA), čistota
- Biologický materiál v biomedicíně (typy, způsob odběru a zpracování, biobanky)
- Experimentální modely v biomedicíně, in vitro a in vivo, buněčné modely a modelové organismy, transgenní organismy
- Příprava buněk a tkání před aplikací protilátek; fixace buňky / tkáně, imunochemické a imunofluorescenční vizualizace
- Proteomika, definice, obecný postup proteomické analýzy včetně využití hmotnostní spektrometrie
- Zpracování vzorku pro analýzu proteinů (izolace, ochrana, přečištění)
- Metody stanovení koncentrace proteinů (Bradford, Lowry, BCA, UV)
- Elektroforetická separace proteinů a následné analýzy
- Imunoglobulin, monoklonální a polyklonální protilátky, laboratorní metody využívající protilátky.
- Příprava monoklonálních protilátek
- Klonování nukleových kyselin, restrikční nukleázy a další enzymy pro manipulaci s DNA/RNA.
- Metody přenosu genetické informace do prokaryotických a eukaryotických buněk Transformace, transfekce, elektroporace, virové vektory
- Struktura a stabilita proteinů (CD, termodenaturace), určování struktury (X-ray, NMR, cryo-EM).
- Podstata interakce proteinů s jinými molekulami a metody studia: imunoprecipitace+ChIP, EMSA
- Interakce proteinů s jinými molekulami: FRET, fluorescenční polarizace, isotermální titrační kalorimetrie, Thermal shift assay, SPR
- Obecný postup při vývoji nových léčiv (molekulární cíl, screening, hit, optimalizace Lead compound, Lipinského pravidla, farmakokinetika, ADME), Klinické studie