- Základní patofyziologické pojmy (Zdraví a nemoc, symptom, syndrom, nozologická jednotka, průběh a důsledky nemocí.)
- Genetická podmíněnost nemocí (Nemoci podmíněné mutacemi genů, chromozomů (autozomní, heterozomní))
- Zánět (Charakteristika zánětu, druhy zánětů, zánětové mediátory; Horečka, mechanismus vzniku, typy horečky)
- Onkogeneza (Faktory vyvolávající nádorové onemocnění, průběh, interakce nádoru s organismem)
- Fyziologie a patofyziologie metabolismu I (Fyziologie a patofyziologie výživy, metabolismu cukrů, tuků, bílkovin)
- Fyziologie a patofyziologie metabolismu II (Fyziologie a patofyziologie vitamínů a jejich souvislosti. Poruchy metabolismu stopových prvků, patofyziologie volných kyslíkových radikálů)
- Fyziologie a patofyziologie imunity (Fyziologie a patofyziologie imunity a jejích složek, imunodeficience, imunopatologické reakce, alergie, anafylaxe, šok)
- Fyziologie a patofyziologie stressu (Regulace stressogenních reakcí, průběh a účast jednotlivých složek stressu, důsledky stressogenních reakcí na organismus)
- Fyziologie a patofyziologie vnitřního prostředí I (Fyziologie a patofyziologie objemové a osmotické rovnováhy a iontové rovnováhy)
- Fyziologie a patofyziologie vnitřního prostředí II (Fyziologie a patofyziologie acidobazické rovnováhy – metabolická/respirační – acidóza/alkalóza)
- Fyziologie a patofyziologie krve I (Fyziologie a patofyziologie leukocytů a erytrocytů)
- Fyziologie a patofyziologie krve II (Fyziologie a patofyziologie hemostázy)
- Fyziologie a patofyziologie kardiovaskulárního systému I (Fyziologie a patofyziologie srdce)
- Fyziologie a patofyziologie kardiovaskulárního systému II (Fyziologie a patofyziologie cévního systému, EKG)
- Fyziologie a patofyziologie respirace (Fyziologie a patofyziologie ventilace, difuse, perfuse, hypoxie, patofyziologie pleurální dutiny)
- Fyziologie a patofyziologie ledvin (Nefrotický sy, akutní renální insuficience, chronické renální selhání uremický sy a jejich orgánové souvislosti)
- Fyziologie a patofyziologie GIT I (Fyziologie a patofyziologie dutiny ústní, jícnu, žaludku a střeva)
- Fyziologie a patofyziologie GIT II (Fyziologie a patofyziologie jater a žlučových cest a pankreatu)
- Fyziologie a patofyziologie NS I (Fyziologie a patofyziologie periferních nervů a nervosvalové ploténky, spinální míchy. Bolest)
- Fyziologie a patofyziologie NS II (Fyziologie a patofyziologie extrapyramidového systému)
- Fyziologie a patofyziologie NS III (Fyziologie a patofyziologie vědomí a kognitivních funkcí, demyelinizační onemocnění. Fyziologie a patofyziologie krevního zásobení NS)
- Fyziologie a patofyziologie endokrinního systému I (Fyziologie a patofyziologie vtahů a regulace ES. Funkce a poruchy hypofýzy)
- Fyziologie a patofyziologie endokrinního systému II (Fyziologie a patofyziologie štítné žlázy a příštítných tělísek, kůry nadledvin)
- Fyziologie a patofyziologie endokrinního systému III (Fyziologie a patofyziologie metabolismu cukrů (DM), Fyziologie a patofyziologie pohlavních žláz)
- Fyziologie a patofyziologie lokomočního aparátu (Fyziologie a patofyziologie kostí a pojivové tkáně)